Vodný tok od ústia do rieky Moravy po cestný most v obci Dubovce.

Čiastkové povodie Chvojnice od cestného mosta Dubovce po pramene.

Čiastkové povodie Čiernej vody od ústia Malého Dunaja pri Starom lese po sútok Stoličného potoka, staré koryto Čiernej vody od ústia Malého Dunaja pod obcou Dolný Chotár po stavidlo pri obci Čierna Voda. Holecov kanál a vodná plocha Feketeér pri obci Kráľ

Čiastkové povodie Čiernej vody od sútoku Stoličného potoka po starý most v obci Kráľová pri Senci a Stoličný potok od ústia po Veľký Grob s prítokom Zichy potoka.

Kanál od cestného mosta Dunajská Streda - Komárno pri obci Dolný Bar po ústie do Klátovského ramena pri obci Topoľníky.

Potok Dubová od ústia pod priehradným telesom VN Sĺňava po cestný most Očkov - Pobedim pri obci Pobedim.

Čiastkové povodie Dudváhu od ústia Čiernej vody po ústie Gidry pri obci Malá Mača, potok Šárd od hate VN Šárd po sútok Salibským Dudváhom, Salibský Dudváh od ústia pri obci Čierny Brod po sútok s Čiernou vodou, kanál Pena od ústia Dudváhu po obec Kajal a

Čiastkové povodie Dudváhu od ústia do Gidry pri obci Malá Mača po stavidlo pod diaľnicou pri obci Brestovany, potok Trnávka od ústia po výtok z VN Boleráz, potok Rakyta, Rásovský potok a Krupanský potok od ústia po pramene.

Čiastkové povodie Dudváhu od ústia do Váhu za obcou Siladice po most pri prečerpávacej stanici pri obci Pečeňady.

Čiastkové povodie Dudváhu od mosta pri prečerpávacej stanici pri obci Pečeňady po most v obci Veselé.

Čiastkové povodie Dudváhu od mosta v obci Veselé po cestný most pri obci Pobedim a potok Holeška od ústia po obec Trebatice.

Odstavené ramená: Veľký Lél, Kľúčovecké, Opátske a medzihrádzový priestor v obci Medveďov.

Staré koryto Dunaja od rkm 1810 pri obci Sap po Čunovskú hať v inundácii (12 vypúšťacích polí), po vodnú elektráreň Čunovo, po stredovú hať, po plavebnú komoru, po vyústenie areálu vodných športov v Čunove a po dolnú hranicu ihlanového sklzu hate na obtok

Staré koryto Dunaja pri hati na obtoku VD Čunovo v úseku od dolnej hranice ihlanového sklzu po hať na obtoku.

Vodná plocha priesakového kanála od MVE nad hydrocentrálou v Gabčíkove po Vlčie Hrdlo v Bratislave vrátane Čilistovského kanála I. od ústia do priesakového kanála po stavidlo - zákaz lovu všetkých druhov rýb od 15.3. do 31.5.