Vodná plocha kanála od ústia do rieky Váh po hrádzové teleso VN Krpeľany. V častiach kanála pod hydrocentrálami v Krpeľanoch, Sučanoch a na Lipovci sú zimoviská rýb (15.12.-15.3.) vyznačené tabuľami.

Potok Dobrotka od ústia po pramene.

Vodný tok Dolnej Rudávky od vyústenia od vyústenia z Hornej Rudávky po zaústenie do Balatónu.

Kanál od cestného mosta Dunajská Streda - Komárno pri obci Dolný Bar po ústie do Klátovského ramena pri obci Topoľníky.

Vodná plocha rybníka pri obci Kalinovo.

Potok Dubová od ústia pod priehradným telesom VN Sĺňava po cestný most Očkov - Pobedim pri obci Pobedim.

Čiastkové povodie Dudváhu od ústia Čiernej vody po ústie Gidry pri obci Malá Mača, potok Šárd od hate VN Šárd po sútok Salibským Dudváhom, Salibský Dudváh od ústia pri obci Čierny Brod po sútok s Čiernou vodou, kanál Pena od ústia Dudváhu po obec Kajal a

Čiastkové povodie Dudváhu od ústia do Gidry pri obci Malá Mača po stavidlo pod diaľnicou pri obci Brestovany, potok Trnávka od ústia po výtok z VN Boleráz, potok Rakyta, Rásovský potok a Krupanský potok od ústia po pramene.

Čiastkové povodie Dudváhu od ústia do Váhu za obcou Siladice po most pri prečerpávacej stanici pri obci Pečeňady.

Čiastkové povodie Dudváhu od mosta pri prečerpávacej stanici pri obci Pečeňady po most v obci Veselé.

Čiastkové povodie Dudváhu od mosta v obci Veselé po cestný most pri obci Pobedim a potok Holeška od ústia po obec Trebatice.

Čiastkové povodie Dudváhu od cestného mosta v obci Pobedim po stavidlo pri vodnom zdroji v Čachticiach a Čachtický kanál od ústia do kanálu pod hydrocentrálou v obci Horná Streda po premostenie, tzv. Černáčkin most v lokalite Černáčkina.

Čiastkové povodie rieky Dunaj od ústia Ipľa (rkm 1708) po ústie Vážskeho Dunaja (rkm 1766) v Komárne.

Čiastkové povodie rieky Dunaj od ústia Vážskeho Dunaja v Komárne (rkm 1766) po rkm 1810 pri obci Sap a Medveďovské rameno.

Odstavené ramená: Veľký Lél, Kľúčovecké, Opátske a medzihrádzový priestor v obci Medveďov.